La técnica del «corta y pega» llega al ADN basura

La comunidad científica llevaba años intentando encontrar un método eficiente y fiable para explorar el genoma hasta que dieron con la revolucionaria técnica en biología molecular del «corta y pega» (conocida científicamente como la técnica CRISPR-Cas9). Sin embargo, hasta ahora ese procedimiento, mucho más potente que los antiguos métodos de edición del genoma, aún presentaba algunas limitaciones. Por ejemplo, era muy útil cuando se trata de editar fragmentos del genoma que codifican para proteínas pero, en realidad, sólo el 1 por ciento del genoma forma parte de este grupo. El 99 por ciento del genoma restante, «la materia oscura» o lo que conocíamos como «ADN basura» todavía no podía beneficiarse de las ventajas que presentaba esta técnica.

Ahora, investigadores del Centro de Regulación Genómica (CRG) liderados por Rory Johnson, presentan un nuevo método que permite utilizar la técnica del CRISPR-­Cas9 también en la materia oscura del ADN, según informa el CRG en un comunicado.

La investigación se ha publicado en la revista BMC Genomics y está disponible en acceso abierto para toda la comunidad científica.

«El método que proponemos amplifica el uso de CRISPR a la materia oscura del ADN. Ampliar su uso a todo el genoma eleva esta técnica a un nuevo nivel y nos permite explorar y editar simultáneamente y de forma más eficiente y barata diversos genes que a menudo tienen funciones reguladoras», explican Rory Johnson y Estel Aparicio, autores del estudio e investigadores del CRG. «Esto será de gran utilidad en estudios donde, por ejemplo, se quieran explorar las funciones de genes ubicados en la zona oscura (llamados “long non-­coding RNAs”) y, no sólo nos permitirá activar o desactivar un gen en cada momento, sino que también podremos manipular redes de genes activando o desactivando diversos genes al mismo tiempo», concluyen los investigadores.

Editar el genoma «a todos los niveles»

«Por fin dispondremos de un método que fácilmente nos permita cortar, pegar, y editar el genoma a todos los niveles», añade Roderic Guigó, coordinador del programa de Bioinformática y Genómica del CRG. «Poder hacer experimentos a gran escala y explorar a esta región “oscura” nos permitirá avanzar mucho en el conocimiento de la regulación de la expresión de los genes y, por lo tanto, profundizar en cómo se gestiona la información que hace que nuestras células, órganos y tejidos sean como son y funcionen correctamente«, afirma el científico. En este sentido, la metodología presentada será la base para poder explotar toda la información que actualmente hay disponible gracias a los proyectos relacionados con el genoma humano y que ponen a disposición de los investigadores datos genómicos. «La técnica del “cortar y pegar” nos permitirá pasar de simplemente leer el genoma a comprender sus funciones y, así poder incidir en la enfermedad», concluye el doctor Johnson.