Michael vuelve a casa de Nika para curar la herida que su hermano tiene en la pierna. A continuación, mientras conducen por una carretera para dejar a Nika en el siguiente pueblo, Licoln y Michael se dan cuenta de que alguien les persigue.
LaSexta emite el final de la segunda temporada de "Prison Break" en dos capítulos. En el primero, tras leer el mensaje en Internet que dejó Mahone, en nombre de Sucre, sobre la localización de T-Bag, Linc comprende que Michael ha acudido a apresarlo.
Michael y Sara piden ayuda a Henry Pope, el ex alcaide de Fox River, para que les recupere la prueba que el padre de Sara ocultó a la compañía. Por otro lado, Sucre se encuentra con otro obstáculo mientras trata de reunirse con Mari Cruz.
En el primer episodio de la noche, una pelea entre diferentes razas se desata en la prisión de Fox River. A continuación, en "Subdivisión", un nuevo capítulo de la segunda temporada, los hermanos comienzan a perder las esperanzas de poder escapar del agente Mahone.
Tras estrellarse el coche en el que viajaban Linc y Michael, Mahone los apunta con un arma y parece que no va a dudar en disparar. T-Bag se entera de la captura de los dos hermanos mientras se toma una copa en un bar de veteranos.
En el primer episodio de la noche, Michael es víctima de una emboscada tendida por los hombres de Abruzzi, en la que se vengan de su silencio en el caso de Fibonacci. A continuación, en el capítulo de la segunda temporada "Enterrado", Mahone interrogará a Tweener.
Sarah, Lincoln y Michael oyen el contenido de la cinta, que descubre la conspiración que la presidenta de los EEUU y la Compañía han tramado contra Lincoln. T-Bag visita a un psicólogo y, cuando vé su parecido físico con el psicólogo, le asesina y le roba la identidad.
Sara se reúne con Michael y Linc en una estación de tren, donde descubre que Kellerman trabaja para ellos. Todos se dirigen a Chicago, ya que allí se encuentra la caja que abre la llave que dejó el padre de Sara y que podría resolver el misterio que envolvió su muerte.
La decadencia del poder de Abruzzi en prisión pone el plan de fuga en situación de riesgo. A continuación, un nuevo episodio de la segunda temporada. Con el agente del FBI Mahone siguiendo cada uno de sus pasos, Michael tendrá que idear una manera de escapar.
En el primer episodio de la noche, Michael recibe la visita de su mujer, lo que desata las sospechas del agente Bellick y los celos de la doctora Sara. La mujer le da algo que parece una tarjeta de crédito, pero resulta ser algo indispensable para proseguir con su plan. Scofield busca un reloj entre las pertenencias que le fueron confiscadas el día de su internamiento pero descubre que se lo robó un guardia, por lo que necesita la ayuda de todo un experto en robos para recuperarlo. Veronica, LJ y Nick continúan refugiados en la cabaña, donde reciben una visita inesperada que cambiará el rumbo de sus planes.
Michael consigue ver a Sara en el motel que habían acordado. Rápidamente descubrirán que Mahone les sigue de cerca, lo que dará lugar a una intensa persecución. Sucre conseguirá hablar con la hermana de Maricruz, pero las cosas no se pondrán fáciles para el fugitivo.
La cadena estrena la segunda temporada de "Prison Break", marcada por el intento de los fugitivos por escapar de los dispositivos policiales. En el primer episodio, mientras los fugitivos tratan de evitar a la policía, el equipo comienza a resquebrajarse.
En el primer episodio, Michael y Lincoln deciden jugarse la última carta: encontrarse cara a cara con la Presidenta de los Estados Unidos y canjear la cinta por su libertad. A continuación, Michael y Lincoln están a bordo del barco que les llevará de Chicago a Panamá.
Michael y Lincoln toman como rehén a un cámara de televisión para enviar un mensaje a toda la población. En él, Michael revela la verdadera identidad del agente Mahone y las vidas que éste se ha cobrado.
Tras llevar a cabo el plan de huída, la nueva temporada se sitúa ocho horas después de la fuga, cuando los presos pierden el avión que los esperaba en el helipuerto y tratan de dejar atrás el gran despliegue policial.
Michael observa una foto de los fugitivos en la primera plana de un diario local; lo que le hace entender que su plan de fuga no le será muy fácil de realizar. Además, Mahone contará con un cebo para atraer a Lincoln. Y es que el agente del FBI tiene en su poder a LJ.
Michael vuelve a casa de Nika para curar la herida que su hermano tiene en la pierna. Cuando todo está controlado, vuelve al coche donde ha dejado todas sus pertenencias. Por otro lado, Sucre y C-Note intentarán comunicarse y reencontrarse con sus familias.
Mientras conducen por una carretera para dejar a Nika en el siguiente pueblo, Lincoln y Michael se dan cuenta de que alguien les persigue. Se trata de Bellick y Roy, que van tras la pista del dinero escondido en Utah.
Michael y Licoln consiguen llegar a Utah, pero no son los únicos que han logrado llegar hasta allí. C-Note les espera ya que todos buscan lo mismo, el dinero de Westmoreland.
Michael debe conseguir el mapa que T-Bag guarda en su memoria y buscar la forma de llegar al dinero enterrado. Michael, Lincoln y T-Bag observan incrédulamente el lugar donde el rancho debería estar.
Mahone interrogará a Tweener, quien se negará a hablar. El joven fugitivo pronto se replanteará su situación y accederá a colaborar con el agente. Mientras, Kellerman intentará utilizar a LJ para apresar a su padre, Lincoln.
Sucre consigue apropiarse de la bolsa que contiene los cinco millones de dólares tras apuntar a los que han sido sus compañeros con un arma. Posteriormente, Michael y Sucre se reunirán para darse cuenta de que han sido engañados por T-Bag.
La policía rodea a Michael en un jardín botánico y el fugitivo debe emprender una nueva huida que lo llevará a descubrir la muerte de Tweener. Convencido de que el agente Mahone esconde muchos secretos, Scofield acude a su casa para averiguar algo más sobre él.
Michael y Sara finalmente logran encontrarse en Nuevo México. Lincoln recibe ayuda de su padre, a quien LJ nunca ha conocido. Paralelamente, Sucre intenta contactar por teléfono con Maricruz.
Lincoln debe despedirse de otro de sus series queridos para reunirse con Michael; mientras que el intento de huída en avión que había planeado el hermano pequeño se verá frustrado al aparecer Mahone, quien ha descifrado una parte crucial del enigma.
Con Mahone siguiendo cada uno de sus pasos, Michael, acompañado de Lincoln, Sucre y su padre, tendrá que idear una manera de escapar para poder continuar con el plan de fuga. En Kansas, Bellick es investigado por la policía por la muerte de su compañero Geary.
Bellick no está nada contento con su regreso a la prisión de Fox River. Y es que muchos de los internos se la tienen jugada. Fuera de la prisión, Michael y Lincoln deben afrontar un nuevo plan de fuga de sus custodiadores, después de su detención.
Bellick, encarcelado en Fox River, está recibiendo el mismo trato que él impartía a los presos cuando era carcelero. Además, la ex esposa del agente Mahone vuelve a aparecer.
Los hermanos prófugos graban una confesión en vídeo que se difunde por la televisión, llegando a Sarah, que logra descifrar el mensaje oculto: un lugar, un día y una hora, donde deben encontrarse. Lo que Michael ignora es que también Mahone ha descifrado el código.
C-Note se ve en una situación complicada cuando un ladrón quiere robar la cafetería en la que come y acaba secuestrando a los clientes. Por otro lado, Michael, Lincoln y Kellerman, con la ayuda se Sara, darán un nuevo paso en el destape de la conspiración.
Michael y Sara piden ayuda a Henry Pope, el ex alcaide de Fox River, para que les recupere la prueba que el padre de Sara ocultó a la compañía. Por otro lado, Sucre se encuentra con otro obstáculo mientras trata de reunirse con Mari Cruz.
Sarah, Lincoln y Michael oyen el contenido de la cinta. Esta, descubre la conspiración que la presidenta de los EEUU y la Compañía han tramado contra Lincoln. T-Bag visita a un psicólogo y, cuando vé su parecido físico con el psicólogo, le asesina y le roba la identidad
Al tiempo que Michael decide encontrarse cara a cara con la presidenta, Bellick y Sucre forman una sospechosa alianza. T - Bag se mete en problemas al perder su equipaje con todo el dinero dentro. Mientras, C-Note afronta las mayores consecuencias de sus actos.
Sara se entrega al FBI para que Michael y Lincoln escapen a Panamá. Por otro lado, en México, Bellick obliga a Sucre a buscar el dinero de Westmoreland. Finalmente, C-Note testifica contra Mahone y es liberado.
El día del juicio de Sara ha llegado y en él se desacredita una prueba que la exhonera. Mientras tanto, Michael, en Panamá, no está dispuesto a perder el dinero de Westmoreland ni dejar libre a T-Bag. Lincoln, por su parte, tendrá su particular cara a cara con Mahone.
Michael en Panamá intenta salvar a su hermano de las garras de Mahone. Y es que el agente del FBI le ha propuesto un trato: él dejará ira a Lincoln si el fugitivo le entrega su plan de fuga y el dinero de Westmoreland.
